黄丽丽于1961年4月出生。自1978年10月起，她进入西北农学院植物保护专业学习，并于1982年6月顺利完成学业，获得农学学士学位。毕业后，她于同年6月进入陕西省果树研究所工作，担任实习研究员一职，直至1985年10月。此后，她于1985年11月转入西北农业大学任教，在随后的十余年间，先后担任助教、讲师、副教授等职务，积累了丰富的教学与科研经验。在此期间，她于1987年9月至1991年6月继续深造，在西北农业大学攻读植物病理学专业，并成功取得农学硕士学位。 1997年11月，黄丽丽前往德国霍恩海姆大学进行为期两年多的研修，于2000年2月结束。回国后，她于2000年3月起在西北农林科技大学担任副教授。2001年8月至同年11月，她再次赴德国霍恩海姆大学担任访问教授；随后于12月回国，被聘任为西北农林科技大学教授、博士生导师。此后，她多次赴海外进行学术交流：2004年7月至9月，她再次在德国霍恩海姆大学担任访问教授；2005年8月至10月，她在德国联邦农业科学院担任访问教授；2007年5月至10月，她又前往加拿大马尼托巴大学担任访问教授。 2010年6月起，黄丽丽在西北农林科技大学担任副院长，同时继续承担教授及博士生导师的工作，直至2017年7月。在此期间，她于2016年1月至2月赴美国华盛顿州立大学担任访问教授。2019年4月至7月，她又一次以高级访问学者的身份前往德国霍恩海姆大学进行学术交流。2023年，黄丽丽因其在植物保护领域的突出贡献，进入中国工程院院士增选有效候选人名单，这标志着其学术成就获得了国内同行的高度认可。
截至2023年4月，针对我国主要果树产业长期面临重大病害频发高发、流行规律错综复杂、安全高效防控技术体系相对匮乏等一系列严峻挑战，黄丽丽及其研究团队持续开展了系统性攻关，重点围绕苹果树腐烂病、苹果褐斑病、猕猴桃溃疡病等关键病害的致灾机理与防控技术进行了深入探索。在苹果重大枝干病害尤其是腐烂病的研究中，团队澄清了以往关于病原菌种类、入侵途径、病斑形成与复发机制等方面存在的若干错误认识，在此基础上创新性地提出了“夏防冬病”的防控新策略，并配套构建了“一防两控”关键技术体系。同时，系统阐明了苹果褐斑病等叶部病害的灾变规律与发生条件，研发出一套轻简化、易操作的防控关键技术，进而整合创新了苹果重大病害一体化综合防控策略与技术体系。 特别在近年来的研究中，团队从病原细菌丁香假单胞菌猕猴桃致病变种与木本果树互作的理论基础入手，系统揭示了该病菌入侵猕猴桃茎、叶、根不同组织的具体过程，阐明了其在细胞与组织水平上的侵染机理及时空动态规律；首次明确了病菌在树体内部不同部位的周年消长动态，并将其与田间病害发生高峰期的更替规律进行了关联分析；同时查明冷凉低温是影响树体内病菌繁殖、扩展乃至病害大面积流行的关键气象因子。基于上述理论突破，团队研发了针对花粉、苗木及接穗带菌的快速检测技术、病害早期诊断方法以及配套的花粉无损消毒工艺；创建了猕猴桃“两前两后”精准施药关键技术；并成功开发出以芽孢杆菌为主体成分的复合微生物菌剂及其配套应用技术。在此基础上，进一步制定了涵盖地上与地下、树内与树表、病前与病后协同治理的“三结合”防病新策略，构建了以“监测预警、精准用药”为核心思想的绿色防控技术体系。 截至2024年10月，黄丽丽先后主持了包括国家973计划项目、国家重点研发计划项目、国家自然科学基金重点项目在内的各类科研项目共计50余项。同期，她作为主要完成人荣获国家科技进步二等奖2项，并获得省部级及社会力量设立的科技奖励15项。在标准制定方面，她主导或参与制定了5项行业及地方标准。此外，在知识产权领域，黄丽丽已获得授权国家发明专利23件，这些专利技术为其相关防控策略的落地推广提供了重要支撑。
截至2022年1月，黄丽丽在教学工作中承担了一门本科生课程，同时面向研究生开设了三门专业课程。截至2023年12月，她在人才培养方面取得了显著成果，累计指导了九十余名研究生及留学生，并教授过两千多名本科生；其教学表现深受学生认可，在学生评教中成绩长期保持优异，始终位于前列。在她悉心指导下，所培养的研究生中有两人荣获陕西省优秀博士学位论文，一人获得宝钢优秀学生奖，四人摘得植物病理学创新奖，另有四人取得国家奖学金。截至2024年10月，黄丽丽在教学成果方面再获重要肯定，分别获得一项国家级教学成果一等奖和一项国家级教学成果二等奖，体现了其在教育教学领域的持续贡献与突出水平。
截至2023年12月，黄丽丽获出版著作4部。
截至2023年12月，黄丽丽已在学术领域取得了丰硕的出版成果，累计在包括《Nature Communications》在内的多种国内外专业期刊上正式发表研究论文超过210篇。这些论文涵盖了她长期深耕的多个研究方向，体现了其持续而活跃的学术贡献，并在相关学科领域内产生了积极的学术影响。
截至2023年3月，黄丽丽通过多种形式持续开展果树重大病害防控技术的推广与培训工作，包括组织专题培训会、深入田间进行现场指导、向果农发放图文并茂的技术手册等，其科技服务惠农的累计人次已超过300万。为了让更广泛的果农群体能够便捷地获取专业知识，近2年来，黄丽丽积极拓展新的传播渠道，应邀尝试利用网络直播方式进行农技传授。例如在2022年3月，她受邀在陕西广播电台开展了一场关于苹果树腐烂病综合防控的专题讲座，节目上线后仅两天播放量便突破20万次，取得了显著的社会反响。2024年5月，黄丽丽在眉县针对猕猴桃园常见病虫害防治技术进行了系统培训，其中详细讲解了溃疡病危害猕猴桃的具体症状、田间表现以及与之配套的防治技术，有效帮助果农准确识别并科学防控该病害的发生与蔓延。进入2025年3月，黄丽丽再次带领团队深入基层，前往南山花牛苹果基地等生产一线，通过现场操作示范、深入浅出的技术讲解以及面向农户的学术讲座，向当地果农系统传授了针对苹果树腐烂病等常见病害的防控理念，特别强调了从以往被动治疗转向全程主动预防的重要性，推广了一系列兼具科学性与实用性的管理技术。
自投身教育事业以来，黄丽丽始终秉持着极为强烈的事业心与高度的责任感，无论在对待自身还是培养学生方面，都坚持着极高的标准与严格的要求。她在生活中崇尚节俭，却在对教学与科研的投入上格外大方；她在治学与指导中要求严厉，却总在细微处流露出对学生的深切温情；她个人作风朴实无华，但在学术追求与工作品质上却极为讲究，从不降低标准。如今，经过多年不懈的努力与积累，黄丽丽在农业植物保护这一专业领域内，早已成为广为人知、备受尊敬的著名学者，其贡献与影响力得到了同行与社会的广泛认可。