清水崇自幼便对电影创作展现出强烈的热情，还在小学阶段，他就观看了由史蒂文·斯皮尔伯格执导的影片《外星人E.T.》，这部作品深深吸引了他，使他立志将电影作为自己毕生追求的事业。进入近畿大学艺术学科后，他主修戏剧与艺能专业，并在此期间拜师于著名剧本家石堂淑朗门下，系统学习编剧知识。然而他并未完成大学学业，而是选择中途退学前往京都，在电影院和咖啡馆打工维持生计的同时，积极投身于独立电影与舞台剧的实践制作。他曾担任助理导演工作约三四年，但在实际工作中感到难以进一步掌握拍摄与灯光等专业技术，因此决心进入专业电影院校深造。1997年，清水崇顺利考入电影技术美学讲座，成为该课程的首届学员。次年，他创作出一部时长三分钟的短片《家庭访问》，这部作品获得了曾参与编写《午夜凶铃》的知名编剧高桥洋的赏识，高桥洋认为清水崇极具潜力，并将他的两部短片推荐给监制过《午夜凶铃》的资深制片人一濑隆重。一濑隆重观看后十分认可，随即与日本V-Cinema电影公司协商，决定以录像带形式发行这两部作品。最终，这两部电影于2000年正式面世，分别被命名为《咒怨录像带版》和《咒怨2录像带版》。
二零零一年三月二十四日，清水崇执导的个人首部院线电影《富江3：重生》正式公映，这部作品汇聚了酒井美纪、妻夫木聪以及忍成修吾等多位演员的共同演出。到了二零零三年一月二十五日，由他亲自编剧并执导的恐怖电影《咒怨》登上银幕，该片的主演阵容包括奥菜惠、伊东美咲和上原美佐等人；同年八月二十三日，其编导的另一部恐怖电影《咒怨2》也随之面世，此番合作的主要演员有酒井法子、市川由衣与新山千春等。二零零四年五月二十二日，清水崇执导的恐怖片《稀人》上映，影片由冢本晋也与宫下友美领衔主演，并成功荣获了第二十三届布鲁塞尔国际奇幻电影节的金乌鸦奖项；紧接着在十月二十二日，他执导的美国版恐怖电影《咒怨》也与观众见面，该片上映后市场反响热烈，连续两周稳居北美票房排行榜的冠军宝座。二零零六年一月七日，其执导的恐怖片《轮回》上映，优香、香里奈和椎名桔平在片中担纲主演；同年十月十三日，由他拍摄的美国版恐怖电影《咒怨2》也如期上映，这部影片由爱波·塔布琳、陈冠希等演员联袂出演。二零零七年四月二日，清水崇与北浦嗣巳、中田秀夫共同执导的奇幻悬疑剧集《怪奇大作战 2nd File》首次播出。二零零八年二月二日，他担任制片人的纪录片《草间弥生之最爱》正式上映。二零零九年六月二十七日，由他担任监制的两部恐怖电影《咒怨：白老妇》和《咒怨：黑少女》选择在同一天登陆影院；同年十月十七日，其执导的3D恐怖电影《战栗迷宫3D》于东京举行首映，柳乐优弥、莲佛美沙子以及胜地凉等演员参与了该片的演出。二零一零年八月三十日，清水崇受邀出任第六十七届威尼斯国际电影节3D电影单元的评委。二零一一年九月十七日，他拍摄的恐怖电影《恐怖兔子3D》上映，满岛光、香川照之与大森南朋等演员在片中共同主演。二零一三年十月二十四日，由他担任监制的恐怖电影《僵尸》上映。二零一四年三月一日，其执导的奇幻电影《魔女宅急便》公映，小芝风花、宫泽理惠以及尾野真千子等演员加盟了此片；同年六月十一日，他执导的惊悚恐怖电影《7500航班》上映，瑞恩·柯万腾、艾米·斯马特与莱丝莉·比伯等演员在该片中合作演出。二零一五年十一月二十八日，清水崇与本广克行、中田秀夫、佐藤嗣麻子联合执导的多元素系列剧《世界奇妙物语 25周年秋季特别篇 电影导演篇》开始播出，其中清水崇负责执导《谎言诞生之日》单元。二零一六年六月十八日，由他担任编剧的恐怖电影《贞子VS伽椰子》上映。二零一七年五月初，他担任监制的惊悚悬疑电影《恐惧罐头》正式开机；五月二十七日，由其担任制片人的CG动画电影《生化危机：复仇》上映；六月十七日，他拍摄的恐怖电影《童使》上映，该片由泷泽秀明、有冈大贵和门胁麦联合出演。二零二零年二月七日，其执导的恐怖片《犬鸣村》按计划上映。二零二三年四月十七日，清水崇执导的全新恐怖片《大家的歌(暂译)》发布了官方海报，并定档于同年八月十一日在日本上映。二零二四年七月十九日，由他执导并参与编剧的电影作品《那个孩子是谁？》最终与广大观众见面。
当观众对恐怖电影的体验达到一定深度后，那些单纯依靠暴力与血腥杀戮的场面往往已难以激起内心的波澜，相比之下，清水崇凭借其独特的视听语言所营造的恐怖氛围，却能在人心中留下持久而深刻的阴影，这种手法确实显得尤为高明。作为一位以强烈影像风格著称的导演，清水崇对画面美感的追求可谓精益求精，在《轮回》中，其拍摄手法既从容又精炼，通过大量依靠镜头进行叙事的技巧，在不经意间将观众的视线引入故事深处。影片中的画面常常带有微妙的偏移感，强烈的立体空间表现自然而毫不生硬，有时镜头的移动极其缓慢，使得观众越是全神贯注于画面中央，越容易被边缘某处不易察觉的细节所吸引，仿佛预感到某种不安即将降临，这种心理上的牵引与悬疑感，正是清水崇希望观众体验到的重要效果之一。而在《咒怨》里，清水崇进一步采用非线性的叙事结构，为传统恐怖片类型注入了崭新的活力，同时也塑造出一些既独特隐秘又令人深感畏惧的银幕形象，这些形象往往在观众的记忆中萦绕不去，展现出导演在恐怖美学上的深刻探索。