周琪于1987年9月进入东北农业大学学习，并在此先后完成了本科阶段的学习，顺利获得学士学位，随后又继续深造，于1994年取得硕士学位，并于1996年获得理学博士学位。1997年3月，他进入中国科学院发育生物学研究所博士后流动站从事研究工作，期间凭借出色的科研能力获得了副研究员的任职资格。1999年3月，周琪前往法国国家农业研究中心分子发育生物学部开展博士后研究，同时担任项目负责人直至2002年；在法国留学期间，他还受聘担任了科技部海外特聘政策专家。2001年，他成功入选中国科学院百人计划。2002年12月，周琪结束在法国的留学工作回到中国，加入中国科学院动物研究所，担任研究员及博士生导师。2004年5月起，他开始担任计划生育生殖生物学国家重点实验室副主任，这一职务一直持续到2011年12月。2005年，周琪获得了国家杰出青年科学基金的资助。2008年6月，他被任命为中国科学院动物研究所所长助理，任职至2012年6月。2011年12月，随着实验室名称调整，他转任干细胞与生殖生物学国家重点实验室（即原计划生育生殖生物学国家重点实验室）主任。2012年6月，周琪出任中国科学院动物研究所副所长。2013年，他入选“万人计划”第一批科技创新领军人才。2014年，在国际学术组织中，周琪被推选为国际干细胞组织主席。2015年12月7日，他当选为中国科学院院士。2016年1月，周琪开始担任中国科学院大学副校长，兼任校学术委员会主任，分管学校的科研工作，直至2017年10月；同年6月12日，他当选为第五届农业转基因生物安全委员会委员；同年11月，在发展中国家科学院第27届院士大会上，他荣获生物学奖。2017年7月，周琪出任中国科学院动物研究所所长（试用期一年）；同年10月，他当选为中国共产党第十九届中央委员会候补委员。2018年1月16日，他当选为发展中国家科学院院士；自2018年8月起至2023年9月，周琪兼任第十届中国侨联副主席。目前，他担任中国科学院副院长、党组成员，同时兼任北京干细胞与再生医学研究院理事长，以及中国科学院大学党委书记、校长等职务。周琪
周琪主要从事细胞重编程与干细胞研究。在体细胞重编程的新方法创建与调控机制研究、干细胞与再生医学重要细胞与动物模型的建立等方面取得了多项系统性、创新性的研究成果。曾先后创造了体细胞克隆大鼠、诱导多能干细胞小鼠，证明了诱导多能干细胞具有与胚胎干细胞同样的发育能力；创建了北京干细胞库；发现了可以判断干细胞多能性水平的非编码RNA标识并研究了其调控机制；揭示了mRNA甲基化等表观遗传修饰在细胞重编程中的调控作用及机制。2002年在国际上首次利用克隆体细胞克隆大鼠，该研究内容发表于《Science》。2009年7月在《Nature》发表文章，首次利用iPS细胞通过四倍体囊胚注射得到存活并具有繁殖能力的小鼠，从而在世界上第一次证明了iPS细胞的全能性；2010年4月在Journal of Biological Chemistry发表文章，首次发现并明确证明了决定小鼠干细胞多能性的关键基因决定簇，可作为判断干细胞多能性水平的分子标识。周琪的研究成果——验证iPS细胞全能性——入选了2009年美国《时代周刊》评选的年度十大医学突破、当选为两院院士评选2009年度中国十大科技进展新闻之一及2009年度中国基础研究十大新闻之一。截至2017年，周琪先后主持了多项国家级科研项目，担任国家重点基础研究发展规划项目（973）项目首席科学家，国家重点基础研究发展规划项目（863）干细胞与组织工程专项总体专家组副组长，长期担任中国科学院干细胞与再生医学领域首席科学家。截至2017年，周琪出版著作2本，在干细胞领域已在 Cell，Nature，Science等刊物发表SCI论文100余篇，获得重编程及干细胞技术发明专利9项。代表论文（#为共同第一作者，*为通讯作者）Li TD#，Feng GH#，Li YF#，Wang M#，Mao JJ，Wang JQ，Li X，Wang XP，Qu B，Wang LY，Zhang XX，Wan HF，Cui TT，Wan C，Liu L，Zhao XY，Hu BY，Li W，Zhou Q*. （2017） Rat embryonic stem cells produce fertile offspring through tetraploid complementation. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Oct 23.He ZQ#，Xia BL#，Wang YK#，Li J，Feng GH，Zhang LL，Li YH，Wan HF，Li TD，Xu K，Yuan XW，Li YF，Zhang XX，Zhang Y，Wang L，Li W，Zhou Q*. （2017） Generation of Mouse Haploid Somatic Cells by Small Molecules for Genome—wide Genetic Screening. Cell Rep. 20（9）：2227—2237.Gu Q#，Wang J#，Wang L#，Liu ZX，Zhu WW，Tan YQ，Han WF，Wu J，Feng CJ，Fang JH，Liu L，Wang L，Li W，Zhao XY，Hu BY，Hao J*，Zhou Q*. （2017） Accreditation of Biosafe Clinical—Grade Human Embryonic Stem Cells According to Chinese Regulations. Stem Cell Reports 9（1）：366—380.Li X#，Cui XL#，Wang JQ#，Wang YK，Li YF，Wang LY，Wan HF，Li TD，Feng GH，Shuai L，Li ZK，Gu Q，Hao J，Wang L，Zhao XY，Liu ZH，Wang XJ，Li W*，Zhou Q*. （2016） Generation and application of mouse—rat allodiploid embryonic stem cells. Cell 164（1—2）：279–292.Li Z#，Wan H#，Feng G#，Wang L#，He Z，Wang Y，Wang XJ，Li W*，Zhou Q*，Hu B*. （2016） Birth of fertile bimaternal offspring following intracytoplasmic injection of parthenogenetic haploid embryonic stem cells. Cell Res. 26（1）：135—138.Zhou Q#，Wang M#，Yuan Y#，Wang X，Fu R，Wan H，Xie M，Liu M，Guo X，Zheng Y，Feng G，Shi Q，Zhao XY*，Sha J*，Zhou Q* （2016） Complete Meiosis from Embryonic Stem Cell—Derived Germ Cells In Vitro. Cell Stem Cell 18（3）：330—340. （入选2016年度中国十大医学科技新闻）Chen Q#*，Yan M#，Cao Z#，Li X#，Zhang Y#，Shi J#，Feng GH，Peng H，Zhang X，Zhang Y，Qian J，Duan E*，Zhai Q*，Zhou Q*. （2016） Sperm tsRNAs contribute to intergenerational inheritance of an acquired metabolic disorder. Science 351（6271）：397—400. （入选2016年度中国科学十大进展、2016年度中国生命科学领域十大进展）Wan H#，Feng C#，Teng F#，Yang S#，Hu B，Niu Y，Xiang AP，Fang W，Ji W，Li W*，Zhao X*，Zhou Q*. （2015） One—step generation of p53 gene biallelic mutant Cynomolgus monkey via the CRISPR/Cas system. Cell Res. 25（2）：258—261.Chen Y#，Niu Y#，Li Y#，Ai Z，Kang Y，Shi H，Xiang Z，Yang Z，Tan T，Si W，Li W，Xia X，Zhou Q*，Ji W*，Li T*. （2015） Generation of cynomolgus monkey chimeric fetuses using embryonic stem cells. Cell Stem Cell 17（1）：116—124.Chen T#，Hao YJ#，Zhang Y#，Li MM#，Wang M，Han W，Wu Y，Lv Y，Hao J，Wang L，Li A，Yang Y，Jin KX，Zhao X，Li Y，Ping XL，Lai WY，Wu LG，Jiang G，Wang HL，Sang L，Wang XJ*，Yang YG*，Zhou Q*. （2015） m6A RNA methylation is regulated by microRNAs and promotes reprogramming to pluripotency. Cell Stem Cell 16（3）：289—301. （封面文章）Li X#，Wang JQ#，Wang LY#，Wan HF，Li YF，Li TD，Wang YK，Shuai L，Mao YH，Cui XL，Wang L，Liu ZH，Li W，Zhou Q*. （2015） Co—participation of paternal and maternal genomes before the blastocyst stage is not required for full—term development of mouse embryos. J Mol Cell Biol. 7（5）：486—488.Shuai L#，Wang Y#，Dong M#，Wang X#，Sang L，Wang M，Wan H，Luo G，Gu T，Yuan Y，Feng C，Teng F，Li W，Liu X，Li T，Wang L，Wang XJ，Zhao XY，Zhou Q*. （2015） Durable pluripotency and haploidy in epiblast stem cells derived from haploid embryonic stem cells in vitro. J Mol Cell Biol. 7（4）：326—337.Bosley KS，Botchan M，Bredenoord AL，Carroll D，Charo RA，Charpentier E，Cohen R，Corn J，Doudna J，Feng G，Greely HT，Isasi R，Ji W，Kim JS，Knoppers B，Lanphier E，Li J，Lovell—Badge R，Martin GS，Moreno J，Naldini L，Pera M，Perry AC，Venter JC，Zhang F，Zhou Q. （2015） CRISPR germline engineering—the community speaks. Nat. Biotechnol. 33（5）：478—486.Wang J#，Hao J#，Bai D，Gu Q，Han W，Wang L，Tan Y，Li X，Xue K，Han P，Liu Z，Jia Y，Wu J，Liu L，Wang L，Li W，Liu Z*，Zhou Q*. （2015） Generation of clinical—grade human induced pluripotent stem cells in Xeno—free conditions. Stem Cell Res Ther. 2015 Nov 12;6（1）：223. doi： 10.1186/s13287—015—0206—y.Li W#，Li X#，Li T#，Jiang MG#，Wan H，Luo GZ，Feng C，Cui X，Teng F，Yuan Y，Zhou Q，Gu Q，Shuai L，Sha J，Xiao Y，Wang L，Liu Z，Wang XJ，Zhao XY，Zhou Q*. （2014） Genetic modification and screening in rat using haploid embryonic stem cells. Cell Stem Cell 14（3）：404—414.Hai T#，Teng F#，Guo R，Li W，Zhou Q*. （2014） One—step generation of knockout pigs by zygote injection of CRISPR/Cas system. Cell Res. 24（3）：372—375.Zhou Q*. （2014） Balancing the welfare： the use of non—human primates in research. Trends Genet. 30（11）：476—478.Gu Q#，Hao J#，Hai T#，Wang J#，Jia Y，Kong Q，Wang J，Feng C，Xue B，Xie B，Liu S，Li J，He Y，Sun J，Liu L，Wang L，Liu Z*，Zhou Q*. （2014） Efficient generation of mouse ESCs—like pig induced pluripotent stem cells. Protein Cell. 5（5）：338—342.Li W#，Teng F#，Li T，Zhou Q*. （2013） Simultaneous generation and germline transmission of multiple gene mutations in rat using CRISPR—Cas systems. Nat. Biotechnol. 31（8）：684–686.Wan H#，He Z#，Dong M，Gu T，Luo GZ，Teng F，Xia B，Li W，Feng C，Li X，Li T，Shuai L，Fu R，Wang L，Wang XJ，Zhao XY*，Zhou Q*. （2013） Parthenogenetic haploid embryonic stem cells produce fertile mice. Cell Res. 23（11）：1330—1333.Zhang Y，Teng F，Luo GZ，Wang M，Tong M，Zhao X，Wang L，Wang XJ*，Zhou Q*. （2013） MicroRNA—323—3p regulates the activity of polycomb repressive complex 2 （PRC2） via targeting the mRNA of embryonic ectoderm development （Eed） gene in mouse embryonic stem cells. J Biol. Chem. 288（33）：23659–23665.Li W#，Shuai L#，Wan H#，Dong M#，Wang M，Sang L，Feng C，Luo GZ，Li T，Li X，Wang L，Zheng QY，Sheng C，Wu HJ，Liu Z，Liu L，Wang L，Wang XJ，Zhao XY*，Zhou Q*. （2012） Androgenetic haploid embryonic stem cells produce live transgenic mice. Nature 490（7420）：407—411. （入选2012年度"中国科学十大进展）Sheng C#，Zheng Q#，Wu J#，Xu Z，Wang L，Li W，Zhang H，Zhao XY，Liu L，Wang Z，Guo C，Wu HJ，Liu Z，Wang L，He S，Wang XJ，Chen Z*，Zhou Q*. （2012） Direct reprogramming of Sertoli cells into multipotent neural stem cells by defined factors. Cell Res. 22（1）：208—218. （入选中国科学技术信息研究所公布的"2012年中国百篇最具影响国际学术论文"）Sheng C#，Zheng Q#，Wu J#，Xu Z，Sang L，Wang L，Guo C，Zhu W，Tong M，Liu L，Li W，Liu ZH，Zhao XY，Wang L，Chen Z*，Zhou Q*. （2012） Generation of dopaminergic neurons directly from mouse fibroblasts and fibroblast—derived neural progenitors. Cell Res. 22（4）：769—772.Gu Q#，Hao J#，Zhao XY，Li W，Liu L，Wang L，Liu ZH，Zhou Q*. （2012） Rapid conversion of human ESCs into mouse ESC—like pluripotent state by optimizing culture conditions. Protein Cell. 3（1）：71—79.Tong M#，Lv Z#，Liu L#，Zhu H#，Zheng QY#，Zhao XY，Li W，Wu YB，Zhang HJ，Wu HJ，Li ZK，Zeng F，Wang L，Wang XJ，Sha JH*，Zhou Q*. （2011） Mice generated from tetraploid complementation competent iPS cells show similar developmental features as those from ES cells but are prone to tumorigenesis. Cell Res. 21（11）：1634—1637. （封面文章）Li W#，Zhao XY#，Wan HF，Zhang Y，Liu L，Lv Z，Wang XJ，Wang L*，Zhou Q*. （2011） iPS cells generated without c—Myc have active Dlk1—Dio3 region and are capable of producing full—term mice through tetraploid complementation. Cell Res. 21（3）：550—553.Riaz A#，Zhao X#，Dai X#，Li W，Liu L，Wan H，Yu Y，Wang L，Zhou Q*. （2011） Mouse cloning and somatic cell reprogramming using electrofused blastomeres. Cell Res. 21（5）：770—778.Niu Y#，Yu Y#，Bernat A#，Yang S，He X，Guo X，Chen D，Chen Y，Ji S，Si W，Lv Y，Tan T，Wei Q，Wang H，Shi L，Guan J，Zhu X，Afanassieff M，Savatier P*，Zhang K*，Zhou Q*，Ji W*. （2010） Transgenic rhesus monkeys produced by gene transfer into early—cleavage–stage embryos using a simian immunodeficiency virus—based vector. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 107（41）：17663—17667. （获得中国首例转基因猕猴）Zhao XY，Lv Z，Li W，Zeng F*，Zhou Q*. （2010） Production of mice using iPS cells and tetraploid complementation. Nat. Protoc. 5（5）：963—971.Liu L#，Luo GZ#，Yang W#，Zhao X#，Zheng Q，Lv Z，Li W，Wu HJ，Wang L，Wang XJ*，Zhou Q*. （2010） Activation of the imprinted Dlk1—Dio3 region correlates with pluripotency levels of mouse stem cells. J. Biol. Chem. 285（25）：19483—19490. （封面文章，并被选为Paper of the Week，被美国生物化学与分子生物学学会报道）Maruotti J#，Dai XP#，Brochard V，Jouneau L，Liu J，Bonnet—Garnier A，Jammes H，Vallier L，Brons IG，Pedersen R，Renard JP，Zhou Q*，Jouneau A*. （2010） Nuclear transfer—derived epiblast stem cells are transcriptionally and epigenetically distinguishable from their fertilized—derived counterparts. Stem Cells 28（4）：743—752.Dai X#，Hao J#，Hou XJ#，Hai T，Fan Y，Yu Y，Jouneau A，Wang L，Zhou Q*. （2010） Somatic nucleus reprogramming is significantly improved by m—carboxycinnamic acid bishydroxamide （CBHA），a histone deacetylase inhibitor. J. Biol. Chem. 285（40）：31002—31010.Zhao XY#，Li W#，Lv Z#，Liu L，Tong M，Hai T，Hao J，Guo CL，Ma QW，Wang L，Zeng F*，Zhou Q*. （2009） iPS cells produce viable mice through tetraploid complementation. Nature 461（7260）：86—90.Jin L#，Ji S#，Tang X，Guo X，Lu Y，Chen H，Deng H，Zhou Q*，Ji W*. （2009） Isolation and characterization of liver epithelial progenitor cells from normal adult rhesus monkeys （Macaca mulatta）. Cell Res. 19（2）：268—270.Yu Y#，Mai Q#，Chen X#，Wang L，Gao L，Zhou C*，Zhou Q*. （2009） Assessment of the developmental competence of human somatic cell nuclear transfer embryos by oocyte morphology classification. Hum. Reprod. 24（3）：649—657.Dai XP，Hao J，Zhou Q*. （2009） A modified culture method significantly improves the development of mouse somatic cell nuclear transfer embryos. Reproduction 138（2）：301—308.Ma M#，Guo X#，Wang F，Zhao C，Liu Z，Shi Z，Wang Y，Zhang P，Zhang K，Wang N，Lin M，Zhou Z，Liu J，Li Q，Wang L，Huo R*，Sha J，Zhou Q*. （2008） Protein expression profile of the mouse metaphase—II oocyte. J. Proteome Res. 7（11）：4821—4830.Niu Y#，Yang S#，Yu Y#，Ding C，Yang J，Wang S，Ji S，He X，Xie Y，Tang X，Zhou Q*，Ji W*. （2008） Impairments in embryonic genome activation in rhesus monkey somatic cell nuclear transfer embryos. Cloning Stem Cells. 10（1）：25—36.Mai Q#，Yu Y#，Li T，Wang L，Chen MJ，Huang SZ*，Zhou C*，Zhou Q*. （2007） Derivation of human embryonic stem cell lines from parthenogenetic blastocysts. Cell Res. 17（12）：1008—1019.Yang J，Yang S，Beaujean N，Niu Y，He X，Xie Y，Tang X，Wang L，Zhou Q*，Ji W*. （2007） Epigenetic marks in cloned rhesus monkey embryos： comparison with counterparts produced in vitro. Biol. Reproduc. 76（1）：36—42.Yang S*，He X，Hildebrandt TB，Jewgenow K，Goeritz F，Tang X，Zhou Q*，Ji W*. （2007） Effects of rhFSH dose on ovarian follicular response，oocyte recovery and embryo development in rhesus monkeys. 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Science 302（5648）：1179. （受到Nature，Science等杂志评价，并因此获得国际转基因研究genOway奖、入选2003年中国十大科技新闻人物）Zhou Q，Jouneau A，Brochard V，Adenot P，Renard JP*. （2001） Developmental potential of mouse embryos reconstructed from metaphase embryonic stem cell nuclei. Biol. Reproduc. 65（2）：412—419.Zhou Q，Boulanger L，Renard JP*. （2000） A simplified method for the reconstruction of fully competent mouse zygotes from adult somatic donor nuclei. Cloning 2（1）：35—44.用于鉴定或调控细胞多能性的关键基因、microRNA、其他非编码RNA或其组合，发明，2015，第1作者，专利号： ZL201010142746.8一种提高体细胞重编程效率的方法，发明，2011，第1作者，专利号： ZL200810119651.7诱导型神经干细胞的制备方法及应用，发明，2014，第1作者，专利号： ZL201110164400.2无损检测细胞miRNA的表达量及确定细胞类型与状态的方法，发明，2013，第1作者，专利号： PCT/CN2013/075903miRNA对m6A修饰水平的调控方法及其应用，发明，2015，第1作者，专利号： PCT/CN2015/071582无损检测细胞miRNA的表达量及确定细胞类型与状态，发明，2016，第1作者，专利号： ZL201210258472.8一种诱导多能干细胞的培养基及其用途，发明，2014，第1作者，专利号： 201410394740.8一种用于将胚胎干细胞诱导为心肌细胞的培养基及其应用，发明，2015，第1作者，专利号： 201510046646.8一种诱导多能性干细胞的培养体系，发明，2014，第1作者，专利号： 201410109226.5
周琪始终将对学生的悉心培养置于至关重要的位置，为此他制定了一项明确的规定：所有新进入实验室的学生在最初半年内均不得参与任何具体课题，而必须专注于完成两方面的基础任务：一是系统研读本领域的经典著作与重要文献，二是反复练习并熟练掌握各项基本实验技术。他深信，若缺乏深厚的理论积淀与扎实的操作技能，便无法真正开展科研项目，即便勉强取得某些结果，其科学性与可信度也难以保证。此外，在周琪的实验室中还形成了一条广为遵循的不成文传统：只要是学生自主构思并提出的研究课题，即便在他个人看来可能前景有限甚至难以走通，他依然会提供全额的资源支持，给予学生充分探索和尝试的机会。因其在育人方面的突出贡献，周琪于2007年荣获中国科学院颁发的“朱李月华优秀教师”奖，并随后在2010年、2012年及2014年多次获得中国科学院“优秀研究生指导教师”奖项。
一只名为“小小”的iPS小鼠的顺利诞生，不仅标志着一场重要科学革命的胜利，更以中国科研人员独特的智慧延续了自克隆羊“多利”以来的生物技术传奇。这一成就不仅创造了克隆动物技术领域的崭新奇迹，同时也展现了基础科研工作中攻坚克难的非凡典范——这正是动物研究所周琪研究员所引领的突破。（第十届中国科学院杰出青年颁奖词）作为国际知名的干细胞领域专家，周琪在多个前沿方向取得了系统而深刻的成果，包括创建体细胞重编程的全新方法并深入揭示其调控机制、成功构建多种哺乳动物新型干细胞并拓展其应用途径、建立一系列重要人类疾病的动物模型，以及持续推进干细胞临床转化研究。他的工作解决了若干关键性科学难题，这些难题既具有重要的基础理论价值，也对临床医学应用具有显著的推动作用，从而有力促进了相关学科领域的整体进步，并为提升中国在干细胞研究领域的国际地位和影响力作出了突出贡献。