简介：2285年，联邦星舰进取号在经历了与可汗的惨烈对决后，带着满身伤痕返回地球太空港。舰长詹姆斯·T·柯克尚未从挚友斯波克牺牲的悲痛中走出，却又面临一系列变故：麦科伊医生行为日渐诡异，时常闯入斯波克旧舱，言语混乱，最终被强制送医；斯科提被调往新舰精进号；而星际舰队更对神秘新生的创世星下达了封锁令。最令柯克难以接受的是，功勋卓著的进取号即将被迫退役。 就在此时，斯波克的父亲沙瑞克带来一个关乎瓦肯族灵魂归宿的秘密：斯波克的遗体必须返回故乡，而他在临终前已将部分意识与麦科伊融合。因此，柯克必须带领团队重返创世星，找回斯波克的遗棺，并护送承载其灵魂的麦科伊前往瓦肯星完成仪式。然而，星际舰队高层断然拒绝了他们使用进取号的请求。 面对重重阻碍，柯克与昔日战友们决定铤而走险。麦科伊从医院逃脱后试图私自雇船，虽遭逮捕却更坚定了众人的决心。…