一九零零年七月，八国联军攻占北京城。联军士兵在城内肆意焚烧劫掠，对居民进行残酷射杀。大量难民试图逃离京城，书生聂如风(王茂蕾 饰)及其家人亦身处逃亡人群之中。然而逃亡之路困难重重。身为妖类的妻子应蝶目睹民众惨死于洋人枪下，内心沉痛不已。为保障家庭安全，使丈夫聂如风能携两名幼女聂倾城(李一桐 饰)、聂倾心顺利脱身，应蝶决意独自留守阻截敌军。只见她扬手之间，城门轰然闭合，聂如风一家由此被隔绝于城门之外。霎时间天象骤变，应蝶身躯开始异变：漆黑羽翼自背后伸展而出，耳廓与指甲急速生长，瞳孔渐染赤红。暴怒的应蝶恨不能将侵华洋兵尽数诛灭，然其虽具超凡异能，终难抵御近代火器。最终应蝶仍殒命于洋兵枪弹之下。其变身景象恰被同处逃亡途中的民众以影像设备记录。城外聂如风闻得枪响，悲恸难抑，却不愿设想应蝶已然遇难，始终坚信彼此只是途中失散，终有重逢之日。哀伤之中他携两女辗转至上海避难。
此后清朝政权更迭，民国肇建。当年稚龄的聂倾城已成长为亭亭少女。为减轻父亲聂如风负担，供妹妹聂倾心在贵族学堂求学，聂倾城于仙乐思舞厅担任首席歌女。某日更衣之际，聂倾城察觉手背浮现金色光点，背部竟隐约显现羽翼轮廓。年少的地尚不知自身继承了母亲应蝶的半妖特质，仅以为是视觉错觉。上海帮会头目刀疤五爷邀新赴任的巡捕房总长明夏(未知演员 饰)至仙乐思观赏歌舞，为攀附关系，将整箱金条与才貌出众的歌女聂倾城作为赠礼，欲换取明夏对其走私行径的庇护。年轻正直的明夏面对财色诱惑断然回绝，并顺势助聂倾城脱离险境。聂倾城见明夏乃有为青年，又蒙其相救，不禁暗生情愫。
聂倾城悄然返家，恰遇为其留门的父亲聂如风。恪守传统的聂如风见女儿衣着奇特且披覆男子西装，便训诫其应保持闺秀仪态。幸得妹妹聂倾心从旁周旋掩饰，聂如风未能察觉聂倾城从事舞厅工作之事。姐妹二人嬉闹沐浴时，浴缸骤然爆裂，原是聂倾城手部胎记绽放金光所致。此番异象令聂倾城愈感困惑。聂倾心欲参与社会名媛杜夫人举办的宴会，然因缺乏财力与社会地位无法获致请柬，独自黯然神伤。聂倾城知悉后承诺设法带妹妹赴会，聂倾心欣喜万分。然聂氏姐妹抵达宴会后，众女宾皆对聂倾心排挤刁难。聂倾城不忍妹妹受辱，巧妙为其化解窘境。聂倾城至花园透气时，竟再度邂逅明夏，二人皆感机缘巧合。聂倾城主动教导明夏舞步，双方感情迅速升温。
正当诸事顺遂之际，聂如风终发觉聂倾城在仙乐思担任歌女之事，盛怒之下将聂倾城禁足家中。聂倾城自窗口潜出，告知明夏无法继续授舞。明夏言及向晚霞祈愿可实现心愿，聂倾城遂高声诉说愿为父亲分担辛劳的期盼。明夏为聂倾城展现的良善与孝心所深深吸引。
时局动荡之中，那些被镜头记录的影像资料几经流转，最终为《高瞻日报》编辑部所获。记者田凯在整理档案时发现这组标注为“庚子年奇闻”的相片，画面中羽翼张扬的身影虽因年代久远而模糊，却仍透出诡异气息。总编钟国柱审阅时，其母钟太婆桂森恰来送参茶，瞥见相片后手中瓷盏险些滑落。这位历经三朝的老人喃喃低语：“妖现乱世，必生劫数……”言语间眼瞳深处掠过难以言喻的忧惧。钟国柱只当母亲忆起旧年战乱心生感慨，未作深究，却不知钟太婆桂森年轻时曾于沪上亲睹类似异象。
与此同时，留学归来的医学博士思翰正于实验室分析一组特殊生物样本。这些取自不同个体的组织切片皆显示异常细胞结构，其变异特征远超现代医学认知。思翰在实验记录中严谨标注：“样本C-07呈现表皮角质层羽状分化，疑似外部刺激引发的返祖现象，需与历史档案对照研究。”他未曾想到，自己研究的课题竟与四十年前京城那场变故存在隐秘关联。
租界巡捕房内，明夏面对日益复杂的治安形势深感压力。刀疤五爷虽暂时收敛，但其背后牵扯的国际走私网络盘根错节。更令明夏困惑的是，近日多起离奇案件现场皆发现微量金色磷光物质，其成分无法检测。警长孙玛利提醒他：“有些案子水深得很，牵扯到洋人商行就别追太紧。”但明夏翻阅卷宗时注意到，所有异常案件发生地都曾出现过聂倾城演出的踪迹，这究竟是巧合还是另有隐情？
聂倾心在贵族学校图书馆偶然找到一本羊皮封面的手札，内页以工整小楷记载：“光绪廿六年，有翼人现于正阳门，目赤如血，阻洋兵于瓮城。”她好奇地将此事告知姐姐，聂倾城闻言指尖微颤，杯中茶水漾起金色涟漪。而远在北平的文物贩子正在兜售一套庚子年相片，其中赫然包含应蝶变身瞬间的连续抓拍。这些影像如同散落的拼图，正被不同势力悄然收集。
黄浦江畔的暮色中，聂倾城凝视着自己水中倒影，那些若隐若现的金色光点不再转瞬即逝。她开始梦见漫天烽火与黑色羽翼，醒来时枕边常落有细绒。聂如风虽察觉女儿日渐消瘦，却只当是舞厅工作辛劳，更深地沉浸在丧妻之痛与对往事的追忆中。而当年拍摄相片的逃难者后人，如今正在当铺鉴定祖传的柯达相机，镜头深处仍残留着未显影的真相。
所有这些碎片化的线索，如同潜伏在时代洪流下的暗涌，终将在某个时刻交汇碰撞。从京城闭锁的城门到上海摇曳的舞池，从实验室的显微镜到报社的档案室，一场跨越时空的因果正在缓缓浮出水面。那些被岁月尘封的异变，那些潜藏在血脉中的特质，以及那些游走于科学与玄学边界的未解之谜，都将在民国上海的繁华与动荡中，逐渐揭开其神秘面纱。而聂倾城掌心日益清晰的金色纹路，正预示着这段埋藏四十年的往事，即将迎来新的篇章。