绪王爷遭师太所弑，皇太后闻讯后极为震骇，疑心此事乃其余亲王所为。卫王(宗峰岩 饰)入宫觐见皇太后，二人谈及绪王爷身亡缘由。皇太后嘱咐卫王暗中监察其他几位亲王动向，卫王领受懿旨后，将私自率领士卒进入京城的实情禀明。皇太后素来严禁亲王携兵马入京，以防谋逆之事发生，卫王此举已违禁例。皇太后顿时怒不可遏，厉声斥责卫王。卫王惊惧跪地，向皇太后陈明原委：其因忧虑其他亲王可能起兵作乱，故而私自调军入京。皇太后听罢卫王陈述，转怒为喜，未再加以责难。卫王系皇太后亲生之子，深得皇太后信赖。
师太行至孔雀桥，遇一黑衣人。此人面容隐于深暗帽檐之下，难以辨识。师太认出黑衣人身份，面现悲愤之色，厉声质问对方为何施蛊致其狂性大发，残害众多无辜性命。待陆小凤(林峯 饰)抵达孔雀桥时，师太已气绝桥面。花满楼(张晓龙 饰)寻得阿信(张檬 饰)传递噩耗，阿信得知师太死讯，面露愧疚自责之情，深觉自身看护失职，以致师太殒命。
卫王追查绪王爷死因，将嫌疑聚焦于阎铁山。阎府遭一队侍卫军屠戮，上官丹凤(斓曦 饰)与陆小凤及时赶至，制止侍卫军继续杀害手无寸铁的家丁。卫王策马至阎府门外，上官丹凤恳求卫王莫再屠戮无辜仆役。卫王端坐马背沉思片刻，遂下令赦免所有家丁死罪。
陆小凤与上官丹凤进入阎铁山藏匿的密室，阎铁山将二人引至一处通道。通道石闸骤然开启，汹涌水流奔涌而出。陆小凤与上官丹凤沿通道疾奔，至一石门前，然石门紧闭无法开启。二人自忖必死无疑，相拥以待终结。此时立于石门另一侧的阿信无意触动机括，石门瞬时转动，将陆小凤与上官丹凤送出通道。澎湃潮水被阻于石门之内，二人既惊且喜，庆幸得以逃生。
飞燕奉主人之命暗杀花满楼。花满楼虽知飞燕使命即为取己性命，仍以礼相待。飞燕难以下手，返回林中。一男性同伴前来劝说，言其必须完成刺杀任务。飞燕已对花满楼暗生好感，无法狠心执行女主人命令。女主人遂遣数名黑衣人将飞燕擒回。
飞燕陷入两难之境，仍不愿加害花满楼。女主人驱策一条巨蟒缠绕飞燕，飞燕的男性同伴见状骇然失色，立誓必与飞燕共同完成任务。女主人方令巨蟒松开飞燕，同时警告飞燕若未刺杀花满楼，必将丧命。
飞燕遭巨蟒缠绕后气息奄奄，花满楼于野外发现被弃置的飞燕，将其带回住所。花满楼为飞燕更换衣衫，飞燕苏醒时身体虚弱无力。
卫王对绪王爷之死的调查持续深入，逐步收集各方线索。皇太后于宫中密切关注事态进展，时常召见卫王询问查案情形。上官丹凤与陆小凤离开阎府后，继续探访相关人士，试图厘清事件脉络。孔雀桥命案在京中引起诸多议论，各方势力皆暗中关注后续发展。
花满楼照料飞燕期间，察觉其伤势非同寻常，遂仔细查验，发现蟒蛇缠绕所致伤痕带有特异纹路。他暗中查阅典籍，试图追溯此蟒来历。飞燕体力稍复后，时常凝视花满楼，眼中神色复杂难辨。某日黄昏，飞燕向花满楼透露片段往事，言及自幼受训于秘密组织，身不由己。
与此同时，阎府惨案余波未平。幸存家丁四散逃亡，其中数人携重要证物隐匿市井。陆小凤通过特殊渠道获知此讯，与上官丹凤分头寻访这些家丁。历经周折，二人终在城西破庙寻得一名老仆，得知阎铁山生前曾与某位朝中重臣密会数次。
卫王得悉此情报后，暗中调整调查方向，派遣亲信监视数位朝廷官员府邸。某夜，侍卫军于京郊截获一批可疑文书，内容涉及亲王间秘密通信。皇太后审阅这些文书后，神色愈发凝重，令卫王加派人手护卫皇宫各门。
孔雀桥畔，阿信每日皆至师太殒命处祭奠。某日，其于桥墩缝隙中发现半枚玉佩，此物似与黑衣人有关。阿信将玉佩交予陆小凤鉴定，陆小凤认出此乃西域贡品，仅限皇室成员佩戴。此发现令绪王爷命案更添迷雾。
飞燕在花满楼照料下日渐康复，然其内心挣扎愈烈。某日深夜，其男性同伴潜入住所，催促飞燕速作决断。飞燕凝视熟睡中的花满楼，最终摇头拒绝。男性同伴叹息离去，临行前留下警告：女主人耐心将尽。
石门通道事件后，陆小凤与上官丹凤对阎府密室构造产生兴趣，多次返回探查。他们发现密室另有隐蔽出口，通往京城地下暗渠。沿暗渠而行，竟可直达皇宫外围河道。此发现令二人震惊，立即将情况密报卫王。
皇太后知悉地下暗渠之事后，连夜召集心腹大臣商议。宫中守卫增至平日三倍，所有出入人员皆受严查。卫王亲自督率侍卫军巡查暗渠沿线，于某处岔道发现新鲜足迹及零星血迹。
花满楼为护飞燕周全，将其转移至郊外别院。别院四周布设简易机关，以防袭击。某日午后，三名黑衣人突袭别院，花满楼凭借对地形的熟悉与之周旋。激斗间，飞燕挣脱虚弱，掷出暗器助花满楼退敌。黑衣人败退后，花满楼审视所获兵刃，发现其上纹饰与巨蟒伤痕图案如出一辙。
京中局势日趋紧张，各方势力动作频频。《高瞻日报》虽未明言报道，然字里行间暗示亲王间存在纷争。市井流传多种传言，有说绪王爷因掌握某位亲王罪证而遭灭口，有说师太乃受人操控行事。皇太后每日早朝皆仔细观察诸位亲王神色，试图辨明真伪。
卫王根据多方线索，逐步缩小调查范围。某日，其亲信于城外驿站截获密使，搜出书信数封。信中暗语提及“孔雀桥事需善后”、“石门通道当封堵”等语。卫王将密信呈送皇太后，皇太后阅后沉默良久，令卫王继续深挖，务必查明全部关联。
飞燕伤势渐愈，向花满楼坦言所知内情。其所述组织结构与训练方式，令花满楼联想到多年前一桩旧案。他连夜修书致友，查询该组织近年动向。三日后回信抵达，证实该组织确与多位朝廷官员存在牵连。
陆小凤与上官丹凤沿地下暗渠深入探查，于某处洞窟发现兵器贮藏痕迹，虽已搬空，然地面车辙犹新。他们循迹追踪至京郊一处废弃庄园，内中虽空无一人，却寻得数枚与孔雀桥畔相似的玉佩残片。
皇太后综合各方情报，渐次理清脉络。某日召见卫王，授其特殊权限，可调动禁军配合调查。卫王领命后，开始部署大规模搜查行动，重点针对几位亲王府邸及关联官员宅院。
飞燕终向花满楼透露女主人真实身份线索，然言至关键处忽遭冷箭袭击。花满楼护其躲闪，箭矢擦肩而过，钉入柱上，箭尾系有警告帛书。至此，花满楼深知此事已涉宫廷深层争斗。
孔雀桥命案、阎府血洗、密室潮涌、巨蟒缠身诸事，看似独立，实则环环相扣。所有线索渐次汇集，指向一场酝酿已久的宫廷风波。卫王坐镇指挥，陆小凤、上官丹凤、花满楼等人多方探查，真相即将浮出水面。然每近一步，阻挠与危险便增一分，各方势力在暗处角逐，京城上空阴云渐浓。