坐落于749厂区内的独立小楼，在夜幕笼罩下显得格外寂静。方舟借助石忠富事先提供的钥匙，悄无声息地开启了某间设计室的房门。潜入室内后，他正欲启动爆炸装置，却未料到炸药早已被暗中调换。此刻，赵冰(梁镜珂 饰)与万华年率领人员骤然现身，将其严密包围。方舟被押解出小楼时，一眼便看见了同样戴着手铐的石忠富。石忠富眼中燃烧着强烈的憎恨，死死瞪视着他，随即猛然挣脱扑上前去，一脚狠狠踢在方舟的下颌部位。方舟遭受重击，身体沉重地摔倒在地。几名公安人员迅速上前，制止了仍在厉声咒骂的石忠富。
随后，万华年与骆战(赵峥 饰)对方舟展开了审讯。万华年指令工作人员将需要进行对质的石忠富及那名女特务带离现场。在审讯压力下，方舟终于开始陈述。他供认，其针对749厂导弹研制项目所进行的一系列破坏行动，自始至终均由代号“子21”的上级直接下达指令。然而，在过去的一个月里，他与“子21”的联络却突然中断，完全失去了音讯。万华年随即取出那半张残缺不全的照片进行询问。方舟表示自己从未亲眼见过“子21”本人，亦无法确认照片中是否包含此人。但他补充了一个信息：台湾方面近期派遣了名为周福林的人员潜入大陆，其任务之一同样是寻找“子21”。这一供述立即引起了骆战和万华年的高度关注。
与此同时，在另一间会议室里，一场工作会议正在进行。许子风(高明 饰)在会上指出，对于方舟所供述的台湾方面再度派遣人员潜入的说法，目前尚不能完全采信。尽管神秘的“子21”至今仍未显露踪迹，但此次成功抓获方舟与石忠富，无疑是案件侦破工作的一项重要进展。在此过程中，杜仙萍(陶飞霏 饰)率先辨认出照片中的方舟，为此案的突破立下了功劳。万华年虽然态度不如许子风那般热情洋溢，但也同样以明确的方式对杜仙萍提出了表扬。
鉴于乔孚山被杀一案目前所有线索均已中断，侦破工作只能寄希望于在市公安局庞大的指纹数据库中进行极为困难的排查，万华年要求赵冰在时间允许的情况下，随时协助市公安局开展此项工作。万华年再次提及方舟关于周福林已进入大陆的交代，认为这一情报具有重要价值，值得予以高度重视。然而，许子风对此事的反应却显得轻描淡写，这种态度不免令人感到有些异常。许子风进一步说明，总部对此事已有掌握，要求万华年不必过多追问。万华年则表示，倘若有些事情将自己排除在知情范围之外，他将难以有效地配合整体工作。许子风反问道，究竟需要了解哪些具体信息才能实现配合，万华年最终选择了沉默，未再继续争论。
会后，骆战对赵冰谈及许子风先前对杜仙萍的高调表扬。骆战认为，杜仙萍在抓获方舟的行动中确实有所贡献，但功劳尚未达到需要如此大张旗鼓表彰的程度。他借此暗示，许子风与杜仙萍之间可能存在某种特殊关系。赵冰则委婉地表示，骆战或许对杜仙萍怀有先入为主的成见。
另一方面，许子风与魏局长进行了电话沟通。他告知魏局长，根据总部传递的消息，周福林已经进入成都并处于我方监控视野之内。其此行目的有二：首要目的依然是寻找“子21”；第二个目的，则与我方预先设计的行动方向存在关联。魏局长回应称，此情况正合预期。他随即告知许子风，计划的第二步需要尽快推进。原因是已从台湾方面获得消息，罗将军已经身亡，官方对外公布的说法是自杀。罗将军一死，我方布下的第一枚棋子便失去了作用。当前必须尽快实施第二步计划，方能在102内部继续制造混乱，从而确保我方核导弹研制工作的安全推进。否则，102的飞机很可能在短期内再度返回进行干扰破坏。