一九四一年皖南事变发生之后，对日伪势力及日军造成了沉重打击。作为回应，日伪与日军联合发起了名为“清乡”的专项行动。获得秘密情报的徐大夫迅速召来方元(巩峥 饰)商议，指出此次日军的大规模扫荡导致新四军人员伤亡惨重，当前最紧迫的需求是获取盘尼西林与麻醉药品。方元随即前往寻找陈如歌(徐梵溪 饰)，探听姑苏医院的药品储备状况。陈如歌以冷淡的态度告知他，医院至多只能提供二十支，若需更大数量，院长必须向宪兵队提交申请报告。方元带着无奈的情绪返回徐大夫处，表示倘若药品存放在宪兵队内部，则成功获取的可能性微乎其微。然而徐大夫带来了新的消息：宪兵队即将从南京押运一批盘尼西林抵达。方元闻言眼神一动，提出劫持运输车辆的设想，但被徐大夫制止。鉴于珠宝店所处的特殊地位及其隐蔽身份，此类需要公开行动的任务必须交由老彭和于承伦执行。
老彭寻到于承伦后，二人经过数日推敲，共同拟定了一套较为稳妥的行动计划，并呈报给徐大夫。方元在审阅方案时补充了若干关键细节，并决定在行动当日负责策应工作。运送药品的车辆进入城区后，老彭与于承伦依计划展开行动，但过程中意外发生枪击，枪声引来了巡逻的日本宪兵。老彭驾车率先撤离，前往预定地点与接应的顾三会合。于承伦则留下拖住日军，最终在交火中负伤。就在他即将被捕的刹那，蒙面的方元及时赶到，击退了这批日本兵。
未料老彭在撤离途中遭遇警备师设置的关卡，本人被带走调查，日本运输车辆亦遭扣押。北野在办公室内大发雷霆，朱立文建议称袭击者中有人受枪伤，应立即对苏州全城的大小医院及私人诊所进行严密搜查。苏州城随即陷入一片肃杀氛围之中。方元前去拜访陈如歌，希望获得她的协助。由于朱立文搜查力度极大，面对陈如歌的质疑，方元意识到两人之间的隔阂似乎正不断加深。他只得透露自己亦与苏北方面有生意往来，恳请她施以援手。陈如歌勉强表示同意。
朱立文在医院召集全体医护人员进行恐吓训话，并指派玉萍向陈如歌传递消息，表明自己清楚她的所作所为，但此次北野老师极为震怒，希望她停止行动。当晚，陈如歌再次来到朱家为伤员实施手术。手术结束后，陈如歌愤怒指责方元连苏北的钱财都要赚取，此举无异于发国难财。她坦言后悔认识此人，而方元也从未向她表露过爱意。
徐大夫告知方元，老彭的车辆被肖团长扣留，所幸肖团长曾是靳雨堂的旧部，或许存在转圜余地。方元即刻动身前往警备师，向靳雨堂提出若此批交易能够达成，将奉上五根金条作为酬谢。靳雨堂感到十分为难，因宪兵队在此次事件中折损数人，北野正严加追查。此时医院人员前来通报，称陈如歌已失踪三日，且此事与少东家的指示有关。在陈如歌失踪一事形成的压力下，靳雨堂最终将车辆交还给了方元方面的人员。
整个过程中，各方势力在苏州城内展开错综复杂的博弈。药品的紧缺使得医疗救援工作举步维艰，而日军的严密监控更让物资转运难上加难。陈如歌虽对某些做法心存抵触，但仍出于人道主义承担着救治伤员的职责。方元在多方周旋中不断权衡风险与道义，其商业身份与隐秘使命间的矛盾日益凸显。警备师内部的关系网络成为关键时刻的可利用资源，但每一次交易都伴随着巨大的政治风险。北野的愤怒与朱立文的严密搜查使得苏州城的空气仿佛凝固，任何非常规行动都可能引发连锁反应。在这种高压环境下，人物间的信任关系经受着严峻考验，而每一次抉择都可能改变后续局势的发展轨迹。