雷震(李卓霖 饰)意识到自己再次落入美叶子设下的圈套，遂决定前往案件发生地进行详细勘查。万乘风(徐雷智 饰)向朱丽娜追问刘志庸企图杀害她的缘由，朱丽娜拒绝透露实情。万乘风以枪支相胁，朱丽娜便虚构了一套说辞，声称自身乃军统秘密派遣人员，而刘志庸实为冒牌货，因惧怕身份被揭穿故而对她实施加害。万乘风对此深信不疑，朱丽娜进而故作姿态地表示，即便牺牲性命也不能泄露机密任务。雷震携带笔迹鉴定结论面见李司令，却遭到李司令关于劫狱事件的严厉质问。雷震陈述了魏来顺(马晓军 饰)过往建立的战功，李司令仍决定对雷震施以二十军棍的重罚。雷震立誓必将此案彻底查明。为魏来顺承受杖责后，雷震不顾伤势坚持要亲赴案发现场，齐副官只得应允其要求。刘志庸此时亦在现场进行调查，雷震制止其接触尸体以保护现场完整性。刘志庸虽心怀不满，但碍于司令命令，只得带领所属人员撤离。此时朱丽娜抵达现场，雷震命令齐副官清场并将其驱离。
雷震对尸体、手枪及墙面弹痕进行了细致检验，由此推断死者系由狐队员所杀害。在关押乔曼(王梓桐 饰)的牢房中，他发现了搏斗留下的痕迹，并于墙面寻获乔曼被带走前刻写的字迹。雷震分析乔曼曾与两名狐队员发生激烈冲突，随即指令许国璋对所有证据进行拍摄记录，并前往刘志庸处取回帽子与手表两项关键证物。朱丽娜前来寻找雷震，佯装关切其伤势，并赠送止血镇痛药物。雷震心存疑虑，朱丽娜为消除怀疑先行试饮药剂。见雷震仍未打消猜忌，她便故作愠怒状欲转身离去，恰逢许国璋自刘志庸处取回证物返回，朱丽娜瞥见了许国璋手中所持文件袋。朱丽娜离开后，许国璋将乔曼损毁的手表及一顶小型军帽交予雷震。
乔曼被美叶子囚禁于秘密基地，美叶子意图强迫其服用新型药物。乔曼拼死反抗，最终张兰不得不先将其迷晕再行灌药。尽管雷震推断出乔曼遭人劫持，刘志庸却坚称乔曼系被雷小蕾救走。雷震依据手表停滞时间推断案发时刻为零点二十七分，结合墙面的血字痕迹，推测那可能是乔曼留下的隐秘信息。此时黄文书与朱丽娜一同到来，朱丽娜将自己捆绑后伪称前来负荆请罪，企图使雷震相信她就是乔曼本人。她还声称魏来顺实属蒙冤，雷震要求她将这些情况禀报李司令以解救魏来顺。朱丽娜推说自身亦有难处，雷震未为所动，命人带其面见李司令，朱丽娜只得离去。
乔曼苏醒后回忆起在训练班的过往经历。狐队员前来送药时，她佯装目光呆滞之态。狐队员为其解开绳索并喂服药物，待其离开后，乔曼将所服药物尽数吐出。她对囚禁房间展开周密观察，最终在桌面上寻得一本《丁氏家谱》。雷震对案件各环节进行反复推敲，认为现有证据链中存在多处矛盾。他重新检视现场照片，注意到某些细微处与初步判断存在出入。齐副官汇报了当日警卫人员的轮值记录，雷震发现时间线上存在约十五分钟的空缺。许国璋对帽子和手表进行了更专业的检测，在织物纤维中发现了不同于监狱环境的微量物质。
李司令再次召见雷震，对其调查进度表示不满，并要求限期结案。雷震据理力争，提出需要更多时间验证若干关键疑点。刘志庸趁机向李司令进言，暗示雷震因包庇旧部而故意拖延调查。雷震返回办公室后，黄文书悄悄送来一份加密档案，其中记载了数月前某次秘密行动的零星记录。雷震对照案件时间线，发现某些代号与当前事件存在潜在关联。他嘱托许国璋暗中查访这些代号的背景，同时让齐副官重新询问当晚所有当值人员。
朱丽娜再次出现在司令部附近，她的行踪被雷震安排的监视人员记录。雷震注意到她与某位文书人员有过短暂接触，但未立即采取行动。他决定暂时按兵不动，以观察其后续动向。乔曼在囚室中继续搜寻可用之物，她将《丁氏家谱》中某些页码折角作为标记，并尝试用找到的碎瓷片在床板下方刻划信息。美叶子通过隐蔽的观察孔监视乔曼的举动，命令张兰增加药物剂量。狐队员的日常训练照常进行，但基地内的警戒级别被悄然提升。
雷震召集核心调查人员举行秘密会议，将目前掌握的线索进行系统性梳理。他提出假设：整个事件可能涉及多个相互交织的阴谋，而乔曼的失踪与监狱命案仅是其中可见的环节。许国璋汇报了对微量物质的初步分析结果，显示其与城外某区域的土壤成分相符。齐副官则补充道，有卫兵隐约记得案发当晚曾听到异常的车辆声响，但当时未予重视。雷震决定兵分两路，一队人前往城外可疑区域进行侦察，另一队人则对司令部内部可能存在的泄密渠道进行排查。调查在明暗两条线上同步推进，真相的轮廓在重重迷雾中逐渐显现。